1) Nastavení aplikace snad nemůže být lehčí. Jako první se musíte zaregistrovat, přičemž bude vyžadováno vaše IČ. Na základě zadaného IČ se načtou vaše údaje z ARESu (veřejný rejstřík ekonomických subjektů). DIČ nevyplňujete, vyplní se samo po vložení certifikátu. Co musíte vyplnit sami, je označení provozovny a označení pokladny. Označení provozovny získáte z webu finanční správy, kam jste provozovnu museli zadat po získání autentizačních údajů. U této provozovny máte uvedeno její číslo (často 11) a toto číslo zadáte do nastavení aplikace jako označení provozovny. Označení pokladny si můžete vymyslet. Můžete pokladnu buď označit také nějakým číslem, např. 1. nebo slovně, např. "cloud", "internet", "mobilni". Fantazií se meze nekladou.
2) Dále si můžete nastavit, jak se bude zaokrouhlovat celková částka účtenky, což ocení plátci DPH. Zaokrouhlování lze nastavit buď nahoru, dolu, matematicky nebo nezaokrouhlovat. Částka zaokrouhlení bude vstupovat do "nulové sazby" DPH. Můžete také změnit přednastavené hodnoty odesílatele mailu, kterým se posílají účtenky zákazníkům (např. vaše jméno nebo jméno vašeho obchodu), předmět emailu a znění samotného mailu. Hodnotu URL v hranatých závorkách nemažte, místo toho se v mailu ukáže odkaz na vyzvednutí účtenky.
3) Jako poslední musíte nahrát certifikát a vložit heslo, které jste si zvolili při jeho vytváření na webu finanční správy. Certifikát vytvořený finanční správou si uložíte první na disk do vašeho počítače a poté ho načtete do aplikace, napíšete heslo a uložíte.
4) Teď už můžete vystavovat účtenky v souladu s EET.